La Maladie du Huanglongbing des agrumes à Cuba

 

La Citriculture cubaine avant la détection HLB

Le programme de recherches sur les agrumes à Cuba a débuté en 1968 dans le but de fournir des fruits frais pour la demande nationale et le marché de l'Europe de l'Est. En 1990, la superficie consacrée à la culture des agrumes était d’environ 144 000 ha et la production dépassait légèrement le million de tonnes de fruits. Des plantations d'agrumes commerciales ont été établies dans tout le pays. La principale espèce d'agrumes cultivée était l'orange douce. Toutefois la lime perse, la mandarine et la lime mexicaine étaient également cultivées. L’orange aigre était principalement utilisée comme porte-greffe. Cependant, après la détection du virus de la tristeza des citrus (CTV) à Cuba (Batista et al., 1995), la diversification des porte-greffes a été nécessaire.

La disparition du marché des pays de l’Est a provoqué une situation économique nationale critique, à laquelle se sont ajoutés des ouragans à répétition et une sécheresse intense, entraînant des pertes cumulées de 1 165 000 tonnes de fruits et 131 millions de dollars. Par conséquent, à la fin de 2006, la superficie d'Agrumes a été réduite à 42 000 ha et la production à 288 674 t (Cueto et al., 2006).

Détection du HLB et principaux résultats de recherches

La détection du «huanglongbin» (HLB) en Floride aux États-Unis en 2005 et la présence de son vecteur Diaphorina citri à Cuba (González et al., 2000) ont motivé le renforcement d'actions de surveillance épidémiologique et de recherche sur cette maladie. En 2006, la bactérie associée au HLB a été détectée chez des plantes présentant des symptômes typiques de taches marbrées asymétriques des feuilles dans les zones résidentielles de la province de La Havane. Un test moléculaire spécifique réalisé à l’aide de deux systèmes d’amplification par PCR, spécifiques pour la détection de 'Candidatus Liberibacter asiaticus' (CLas), a confirmé la présence de l'agent pathogène dans les échantillons symptomatiques. L'analyse BLAST a révélé que les séquences nucléotidiques obtenues pour l'opéron rplKAJL (numéro d'accession GenBank FJ394022) partageaient une identité de 100% et une identité de 98% avec les séquences de Clas du Brésil (numéro d'accession GenBank DQ471904) et du Japon (numéro d'accession GenBank AY342001) (Luis et al., 2008, 2009).

Figure 1. Symptômes de HLB observés dans les vergers d'agrumes lors des prospections. A: tâches asymétriques B: pousses jaunes; C: carences nutritionnelles; D: fruits déformés avec des graines avortées et rougeâtres, pédoncule enfoncé et faisceaux vasculaires jaunes intenses; E: columelle tordue; F: nervures ressemblant à du liège; G: veines jaunes

Pour déterminer la distribution de la maladie à Cuba, des enquêtes ont été menées dans 11 provinces et dans la municipalité spéciale d'Isla de la Juventud. La présence de HLB a été confirmée par PCR dans toutes les zones inspectées. Les symptômes les plus fréquemment observés dans les plantes infectées étaient des taches asymétriques (figure 1A), des pousses jaunes (figure 1B), des carences nutritionnelles (figure 1C) et des fruits déformés avec de graines avortées et rougeâtres, des pédoncules enfoncés et vaisseaux vasculaires jaunes intenses (figure 1D ) et des columelles tordues (figure 1E). Les autres symptômes étaient des feuilles avec des nervures médianes épaissies, nécrotiques ou ressemblant à du liège (figure 1F), des nervures jaunes (figure 1G) et une chute prématurée des fruits. Des symptômes de HLB ont été observés chez les 20 cultivars d'agrumes présents dans le pays et un guide laminaire a été réalisé pour l'identification de la maladie sur le terrain (Paredes et al., 2015).

Le symptôme de taches asymétriques était le symptôme le plus caractéristique observé chez toutes les espèces et variétés analysées. Ce symptôme a été observé sur les feuilles matures de jeunes ou vieilles plantations de facon plus fréquente d'octobre à mars, lorsque les températures sont plus basses. Cependant, la première symptomatologie observée était des carences nutritionnelles et des pousses jaunes. L'orange, la mandarine et le pamplemousse étaient les espèces les plus sensibles présentant également plus de symptômes. Les citronniers (Citrus limon Burn), les limes acides (C. aurantifolia Swingle et C. latifolia Tanaka, C. volkameriana Tan. et Pasq., C. macrophylla et d'autres espèces similaires) présentaient un très fort marbrage asymétrique des feuilles. Chez ces espèces, les symptômes sur fruits et les défoliations, ainsi que les branches sèches n'étaient pas fréquemment observés et le déclin des arbres était plus lent.

La détection de l'agent pathogène a été réalisée par microscopie optique de fines sections de feuilles colorées avec de l'iode ou du lugol. Cette technique a permis de visualiser les accumulations excessives d'amidon dans le phloème qui représentent une réponse de la plante à la présence d'agents pathogènes. L’analyse a montré une concordance de 97% des résultats de ce test par rapport à la PCR conventionnelle, confirmant son utilité pour la détection du HLB lors d’enquêtes massives (Luis, 2014). Une PCR duplex a été validée pour la détection simultanée des trois espèces de Clas, en utilisant les couples d'amorces GB1 / GB3 et rplA2 / rplJ5. L'évaluation des paramètres de cette technique ont montré une efficacité (≥96,9%) pour l'identification correcte du HLB à partir de feuilles à motifs asymétriques. En outre, il a été déterminé que la bactérie était détectée dans des échantillons de feuilles présentant d'autres symptômes moins spécifiques, tels que des carences nutritionnelles et des pousses jaunes, avec des taux de correlation respectifs de 43,75% et 68,42% (Collazo et al., 2010). Une PCR en gigogne a été validée avec les amorces: fD1 / rP1 (première réaction) et OI1 / OI2c (seconde réaction), pour augmenter la sensibilité du diagnostic. Actuellement, c'est la technique utilisée pour la certification du matériel de propagation des agrumes. Il a également permis la détection chez des nymphes et des adultes de D. citri, avec 95,5% de positivité (Collazo et al., 2011). La technique de greffe de la pointe de pousses in vitro a été utilisée pour éliminer Clas de plantes infectées (Zamora et al., 2015).

Des études descriptives et explicatives de la dynamique de la population de D. citri dans trois zones d'agrumes ont permis d'optimiser la surveillance et le contrôle du vecteur. Les six prédateurs, un parasitoïde et un champignon entomopathogène, qui contrôlent le vecteur à tous les stades de développement, ont été identifiés comme ennemis naturels (Gonzalez et al., 2008, 2010). Sur la base de nos résultats et de l'expérience internationale, nous avons proposé trois aspects fondamentaux pour la gestion des HLB: utilisation de matériel de multiplication certifié produit en serre exempte d'insectes, lutte préventive contre D. citri et réduction de la source d'inoculum. (Llauger et al., 2008)..

A Cuba, le matériel de propagation des agrumes est produit en serre et il est garanti que le matériel utilisé est certifié et sain. Le contrôle du vecteur D. citri a été effectué principalement avec des insecticides et il a été possible de réduire l'incidence de cet insecte dans les vergers. Le principal problème dans la gestion de la maladie a été l'élimination de la source d'inoculum par l'éradication des plantes symptomatiques. En effet, cela affecte les intérêts économiques des producteurs et une loi n’approu 2014, Batista et al., 2017). Dans le reste des entreprises d'agrumes, la stratégie établie a été adaptée en fonction de leurs conditions économiques et de la disponibilité de terres pour les nouvelles plantations.

Des études épidémiologiques ont été menées pour déterminer l'évolution temporelle de la maladie dans les vergers de différentes entreprises d'agrumes du pays. Ces évaluations ont été réalisées dans des blocs de 900 plants avec une fréquence bimensuelle. Les résultats indiquent qu'il existe des différences dans la progression du HLB selon différentes pratiques de gestion. Il a été démontré que la plantation de plantes certifiées éloignées des vergers infectés et symptomatiques, l'élimination de la source d'inoculum et le contrôle préventif du vecteur sont des aspects fondamentaux de la gestion de la maladie (López et al., 2014; Batista et al., 2017).

Impact de la maladie du HLB sur la citriculture cubaine

La présence de HLB dans l'industrie des agrumes cubains a eu un impact important. Des investissements ont été réalisés pour la création d'emplois dédiés à l'identification et à l'élimination des plantes symptomatiques. Des serres ont été construites avec des filets anti-pucerons pour la production de matériels certifiés. Des ressources financières ont été allouées à l’acquisition de pesticides utilisés pour contrôler du vecteur, et de nouveaux moyens d’application ont dû être acquis. En conséquence, la technologie des agrumes est devenue plus chère depuis la présence du HLB. Simultanément, les pertes ont augmenté en raison de la diminution de la production, du calibre commercial et de la chute prématurée des fruits, de la mort des arbres, de la réduction des zones destinées à la citriculture, des cyclones, de la sécheresse et du manque d’intrants. Ainsi, en 2017, une production de 60.205,9 t a été obtenue sur une superficie totale de 14.000 ha, dont 6.000 en cours de développement.

 

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